Genetyka i epigenetyka komórek somatycznych Część 5

A. Definicje

B. Mechanizm odporności adaptacyjnej

C. Różnicowanie limfocytów B
1. Powstawanie limfocytów B

2. Konfiguracja zarodkowa mysiego genu IGH

3. Reakcje w grudce chłonnej
a. „Naiwne” limfocyty B
b. Komórki B w strefie ciemnej GC

4. Struktura wydzielanych immunoglobulin

D. Transmisja sygnałów w komórkach B
1. Transmisja sygnału z receptora BCR

• Sygnalizacja przez Plcγ.p
• Sygnalizacja przez PI3K
• Sygnalizacja przez Ras.p
• Sygnalizacja przez Rac1.p
• Sygnalizacja przez Axl.p
• Sygnalizacja przez Tnfrsf13C.p/BaffR.p
• Wygaszenie sygnalizacji z BCR

2. Transmisja sygnałów z receptorów TOLL (TLR)

3. Tworzenie różnorodności przeciwciał
a. Rearanżacja V(D)J genów IGH
b. Somatyczne hipermutacje regionów CDR genów Ig

• Somatyczne hipermutacje (SHM)
• Konwersja genowa (GC)

c. Przełączenie klasy immunoglobulin

• Mechanizm CSR

E. Różnicowanie limfocytów T
1. Powstawanie limfocytów T
a. Różnicowanie prekursorów limfocytów T
b. Efektorowe limfocyty T

F. Transmisja sygnału w komórkach T
1. Kompleks TCR
a. Receptory i koreceptory
b. Koregulatory TCR

• Białka nadrodziny immunoglobulin
• Białka rodziny TNF
• Białka rodziny TNF receptorów

c. Białka dodatkowe TC
d. Fosfatazy

2. Sygnalizacja z kompleksu TCR
a. Kinazy tyrozynowe
b. Kinazy serynowo‑treoninowe
c. Białka adaptorowe
d. Faktory GEF (aktywatory GTPaz)

3. Aktywacja TCR
a. Okres początkowy aktywacji
b. Późny okres aktywacji TCR

G. Transmisja sygnałów z receptorów cytokin
1. Interferony i interleukiny
a. Interferony (IFN)
b. Interleukiny
c. Receptor Il-2

2. Receptory chemokin
a. Chemokiny
b. Receptory chemokin
c. Receptory TNF
d. Receptory Il1
e. Sygnalizacja Notch.p
f. Sygnalizacja WNT

H. Efektory sygnalizacji
1. Faktory posiadające „palce cynkowe”
a. Białka z palcami Kruppel
b. Zlożone białka z domeną palców cynkowych

2. Białka bHLH (helisa – pętla – helisa)
a. Białka E
b. Specyficzne białka E
c. Białka podrodziny MYC
d. Białka TFE
e. Białka ID
f. Białka HES (hairy enhancer of split)

3. Faktory b-ZIP
a. Białka ATF/CREB
b. Białka AP
c. Białka CEBP (wiążące CCAAT)
d. Białka MAF
e. Białka z domeną PAR

4. Białka z domeną HTH
a. Białka homeoboksu
b. Białka złożone z domeną homeoboksu
c. Inne białka z domenami HTH
d. Białka z domeną MADS
e. Rodzina białek MYB
f. Rodzina białek IRF

5. Białka z dbd typu „fałdy Ig”
a. Rodzina białek REL
b. Białka rodziny RUNT
c. Faktory typu STAT

6. Inne faktory transkrypcji
a. Faktory z domeną RFX
b. Faktory rodziny CSL
c. Faktory SMAD

I. Komórki dendrytyczne

J. Różnicowanie granulocytów i monocytów
1. Różnicowanie granulocytów

2. Różnicowanie monocytów i makrofagów

K. MikroRNA w różnicowaniu

L. Odporność wrodzona
1. System komórkowy odporności wrodzonej
a. Rodzaje PAMP i PRR
b. Komórki limfoidalne wrodzonej odporności (ILC)
c. Sygnalizacja przez receptory typu TOLL (TLR)
d. Inne rodzaje odporności komórkowej

• Stan zapalny
• Fagocytoza

2. System pozakomórkowy odporności wrodzonej
a. Odporność gatunkowa i indywidualna
b. Odporność „anatomiczna”
c. Substancje antybakteryjne
d. System komplementu

• Droga Psmb5.p/Mbl.p
• Receptory systemu komplementu

M. Wrodzone defekty odporności
1. Defekty syntezy immunoglobulin
a. Hipogammaglobulinemie

• Pospolity zmienny niedobór odporności (CVID)
• Wrodzona agammaglobulinemia sprzężona z chromosomem X (XLA, agammaglobulinemia Brutona)
• Przejściowa hipogammaglobulinemia wieku dziecięcego (THI)
• Selektywny niedobór IgA (IgAD)

b. Defekt odporności sprzężony z chromosomem X i nadmiarem IgM (XHIGM)

2. Ciężki złożony niedobór odporności (SCID)
a. SCID sprzężony z chromosomem X
b. SCID z defektem genu ADA
c. SCID z defektem genu JAK3
d. Zespół SCID z nagimi limfocytami (BLS – SCID)
e. SCID z defektem PNP
f. SCID z defektem Il2
g. SCID z defektem ZAP70
h. SCID z siatkową dysgenezją
i. SCID z defektem genów RAG
j. WAS – SCID (w zespole Wiscotta‑Aldricha)
k. Inne zespoły SCID

3. Zaburzenia systemu komplementu
a. Deficyt białka C1
b. Deficyt białka C2
c. Deficyt białka C4
d. Deficyty C3, C5, C6, C7, C8, C9
e. Deficyt FI, FH, FD i properdyny
f. Deficyt HRF20/CD59
g. Deficyt DAF/CD55
h. Deficyt serpiny G1/C1-INH
i. Defekty szlaku Mbl.p

4. Pierwotna dyskinezja rzęskowa

5. Defekty adhezji leukocytów (LAD)
a. Deficyt integryn CD18/β2

6. Defekty fagocytozy
a. Defekt mieloperoksydazy (MPO)
b. Przewlekła choroba ziarniniakowa (CGD)
c. Zespół Chediaka-Higashiego (CHS)

N. Kompleks zgodności tkankowej (MHC)
1. MHC klasy II (MHCII)

2. MHC klasy III (MHCIII)

3. MHC klasy I (MHCI)

4. Odporność i podatność

5. Choroby zależne od MHC
a. Zapalenie stawów
b. Toczeń rumieniowaty układowy (SLE)
c. Cukrzyca insulinozależna (IDDM)
d. Choroba trzewna (celiakia) (CD)
e. Łuszczyca
f. Pęcherzyca pospolita (PV)
g. Autoimmunologiczne choroby tarczycy
h. Stwardnienie rozsiane (MS)